Ao abrigo do disposto nos Estatutos da Fundação Centro Cultural de Belém, o Ministro de Estado e das Finanças e a Ministra da Cultura nomeiam os vogais do Conselho Directivo da Fundação, activando um órgão que se mantinha inactivo até à data e respondendo, assim, a uma pretensão da Fundação.
A Ministra da Cultura designou para o cargo de vogal: Álvaro José Brilhante Laborinho Lúcio, João Manuel Gaspar Caraça, Lídia Guerreiro Jorge, Maria Clara Ferreira Alves e Vasco Alexandre Vieira de Almeida. O Ministro de Estado e das Finanças designou para o cargo de vogal: António Jorge Duarte Rebelo de Sousa.
Compete ao Conselho Directivo da Fundação, nomeadamente, definir e estabelecer as políticas gerais de funcionamento e orientação de investimento da Fundação, e discutir e aprovar o orçamento e o plano anual de actividades da Fundação, o plano trienal de actividades culturais e o balanço anual e as contas de cada exercício.
O Conselho Directivo da Fundação Centro Cultural de Belém é composto por sete membros. O presidente da Fundação é, por inerência, presidente do Conselho Directivo e do Conselho de Administração. Os vogais do Conselho Directivo são designados do seguinte modo: cinco pelo Ministro da Cultura e um pelo Ministro de Estado e das Finanças. O mandato do Conselho Directivo é de três anos.